Der Peenefluss, kurz Peene genannt, umfasst den Peenekanal
(0,0 - 2,5 km), eine von Malchin bis zum Unterlauf der Westpeene führende künstliche Wasserstraße, den Unterlauf der Westpeene (2,5 - 4,6 km), die Fahrstraße durch den Kummerower See
(4,6-15,1 km) und den eigentlichen Fluss (15,1-104,6 km) vom Kummerower See bis zum Peenestrom. Der Peenefluss von Malchin bis zur Mündung durch den Richtgraben in den Peenestrom ist in voller Länge (etwa 96 km) eine dem allgemeinen Verkehr dienende Binnenschifffahrtsstraße des Bundes. Die amtliche Kilometrierung beginnt im Hafen von Malchin mit 0,0 km und endet an der Mündung in den Peenestrom mit 104,6 km. Die Fehlkilometer zur wirklichen Länge erklären sich durch die Verkürzungen infolge zahlreicher Durchstiche in den letzten Jahrzehnten. Die Fahrt auf der Peene wird nicht durch Staustufen, wohl aber durch drei Brückendurchfahrten (Klappbrücken in Anklam und Demmin sowie die Drehbrücke in Loitz) beeinträchtigt. Die Peene ist der größte Fluss in Mecklenburg-Vorpommern mit einzigartiger Reichhaltigkeit an Flora und Fauna. Auf etwa 96 km Länge schlängelt sie sich durch Niedermoore, Torfstiche, Bruchwälder, Flussauen und selten auch durch einzelne Ortschaften.